在科技与文明特别是科学与儒学联系研讨方面，马来平带领他的团队首要聚集以西学东渐（1582-1928年）为实证根底的科技与儒学联系研讨。其一，在剖析西学东渐中科学与儒学联系研讨的方法论时，清晰了明末清初西学东渐中科学与儒学联系研讨的规模，勾勒了西学东渐中科学与儒学联系的头绪，提出了研讨明末清初科学与儒学联系应掌握的首要准则；其二，多视点多旁边面地证明了科学与儒学具有根本上的相容性及其和谐开展的途径；其三，讨论儒学人文资源的现代价值和“两创”途径；其四，在展开“东传科学与儒学的嬗变”系列研讨的根底上拓荒了科技儒学研讨新方向，提出了“科技儒学”概念，大致确认了科技儒学的研讨结构，提炼提高出若干中心概念和范畴，逻辑地建构起与儒学理论全体相和谐的理论化、体系化的儒学知道论。在这方面，马来平完成了《探寻科学与儒学联系演化的前史轨道——我国近现代科技思维史研讨》《西学东渐中的科学和儒学联系——科技儒学初探》等多本论著，在国内外该范畴产生了较大影响。
在我国近现代科技思维史研讨方面，马来平环绕我国的传统科学意图观与科学的联系、我国民间传统文明与科学的联系、严复的科学思维、我国现代科技体制的构成与开展，以及我国科技思维的立异等方面做了深入讨论。其间最重要的效果，一是对严复关于科学与封建文明、关于科学的知道方法及科学的意图观等提出了一些新的知道。这些观点在《哲学研讨》《自然辩证法通讯》《自然辩证法研讨》等期刊上宣布后，英国剑桥李约瑟研讨所和日本东京大学合办的《我国科学史通讯》均做了介绍。二是于1995年策划了一套七册的“我国科技潮丛书”。该丛书由时任我国科学院副院长院士担任主编，作者由北京大学、我国人民大学、我国科学院科学史所和东北大学的一批闻名学者组成。马来平作为编委会履行副主编，除了和谐统筹作业外，还独立撰写了《我国科技思维的立异》一书，厘清了中华人民共和国建立后以科技观和科技开展规律观为中心的科技思维开展头绪，并把我国科技思维置于世界和年代的大布景下，进行了开始剖析和点评。丛书出书后，获山东省第三届精神文明建设“精品工程”奖。
在科技与社会研讨方面，马来平先是在微观研讨方面出书了《科技与社会引论》，后来就将研讨要点转向以默顿学派为代表的科学社会学研讨范畴，先后宣布了一批有影响的论文，出书了《了解科学——多维视界下的科学》和《科学的社会性和自主性——以默顿科学社会学为中心》两书。前者被列入“大学生文明本质教育丛书”。后者出书后，好评不断，《光明日报》《自然辩证法研讨》《科学技术哲学研讨》等重要前言别离刊发闻名学者的谈论文章，以为此书“在许多重大问题上有新的打破”“它们在一些方面现已逾越了默顿的原作，带有发明的含义”“有望改动我国多年以来对有学科创始之功的默顿学派研讨的单薄情况”等。该书当选“国家社会科学基金后期赞助项目”，并相继获评山东省社会科学优异效果一等奖和全国高校人文社会科学研讨优异效果三等奖。
在科普实践和科普理论研讨方面，马来平也做了很多作业。他参加了由教育部托付的《我国公民科学本质基准》文件起草作业；以省政府参事或省政协委员的身份向省政府提交了多件科普提案，并屡次获省长和副省长指示；屡次以大陆代表团副团长的身份到会两岸科普论坛；安排山东自然辩证法研讨会举行全省科普理论专题研讨会；出书了一批有影响的科普著作等。他在科普理论研讨方面宣布了近30篇论文，对科普理论一系列中心问题的研讨有所推动。他的《科普理论要义——从科技哲学的视点看》一书出书后，得到学界好评，并于2020年获评山东省社会科学优异效果二等奖，2022年获山东十大优异科普著作奖。此外，马来平于2013年获评山东省科普奖，2014年当选为山东省科普创造协会理事长。
在教育方面，马来平总结出了一套有用有用的育人形式，他所培育的博士生中有三人获省优异博士论文；其教书育人先进事迹曾以《三句格言育英才》为题，在国务院学位办主办的《学位与研讨生教育》上宣布；他曾先后取得全国先进科技作业人员、山东省优异研讨生辅导教师等荣誉称号。
马来平作为我国自然辩证法研讨范畴的闻名学者和山东省自然辩证法界的首要学术带头人，对山东省自然辩证法学科建设、人才教育训练和学术交流做出了突出贡献。他淡泊明志，悉心治学，在自然辩证法几大专业方向均有建树；一起，他又能走出书斋，服务社会，对当地的科技文明事业建言献计，真实践行了一位知识分子的社会职责，屡次遭到当地政府的赞誉。
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